La endoscopia permite al medico examinar el recubrimento de la parte superior  del tracto gastrointestinal,que incluye el esofago, estomago y el duodeno(la primera parte del intestino delgado).El medico utiliza un tubo delgado y flexible con lente y fuente de luz propias, llamado endoscopio, y visualiza imágenes en un monitor de video. Este procedimiento ayuda al profesional a evaluar los síntomas de dolor abdominal superior. El examen mas adecuado y mas seguro se logra con el estomago vacío.

El médico puede utilizar endoscopia superior para obtener una biopsia (pequeñas muestras de tegido). La biopsia ayuda al medico a distinguir entre tegidos benignos y malignos.